Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P06323 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
P06323 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
P06323 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
P06323 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P06323 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms