Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Myl1P05977 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Myl1P05977 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Myl1P05977 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms