Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

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Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PdgfrbP05622 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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