Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01878 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01878 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01878 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01878 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01878 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P01878 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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P01878 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01878 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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