Protein–RNA interactions for Protein: O88575

Slc6a20b, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3B, mousemouse

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Length 635 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20bO88575 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Slc6a20bO88575 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a20bO88575 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a20bO88575 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a20bO88575 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Slc6a20bO88575 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc6a20bO88575 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc6a20bO88575 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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