Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlkO54988 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SlkO54988 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlkO54988 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlkO54988 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms