Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DffaO54786 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DffaO54786 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DffaO54786 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
DffaO54786 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
DffaO54786 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms