Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Bnc1O35914 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Bnc1O35914 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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