Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Opn1mwO35599 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Opn1mwO35599 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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