Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
KeraO35367 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
KeraO35367 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
KeraO35367 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms