Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
E2f3O35261 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms