Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Casq1O09165 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Casq1O09165 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms