Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

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Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PrkcshO08795 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PrkcshO08795 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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