Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Sema3aO08665 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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