Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
AlyrefO08583 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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