Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Efna3O08545 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Efna3O08545 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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