Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
MsmbO08540 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
MsmbO08540 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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