Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp35M0QWN7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp35M0QWN7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms