Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5849J3QPE5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5849J3QPE5 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5849J3QPE5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Gm5849J3QPE5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm5849J3QPE5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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