Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm2035J3QP87 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms