Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Fam240aJ3QNP9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms