Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gm3336J3QMQ6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm3336J3QMQ6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gm3336J3QMQ6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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