Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lipo1J3QME6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms