Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm6594J3QM43 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Gm6594J3QM43 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm6594J3QM43 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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