Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20830J3KML6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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