Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm20828J3KMI7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm20828J3KMI7 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms