Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rnf148G3X9R7 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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