Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610008E11RikG3X964 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms