Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm2564F6Z9S8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms