Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
ApobE9Q414 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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ApobE9Q414 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
ApobE9Q414 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
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