Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CenpfE9Q3P4 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms