Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fndc1E9Q043 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fndc1E9Q043 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms