Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm20425E9Q035 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms