Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3002E9PW72 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms