Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc144bE9PVZ3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc144bE9PVZ3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms