Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
4931429L15RikE9PVU2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
4931429L15RikE9PVU2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms