Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clca3bE9PUL3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clca3bE9PUL3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms