Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh8D3Z6W3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh8D3Z6W3 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms