Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3543D3Z235 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3543D3Z235 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Gm3543D3Z235 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm3543D3Z235 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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