Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc6D3YZP9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc6D3YZP9 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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