Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Ube2d4D3YUH6 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Ube2d4D3YUH6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms