Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Clip3B9EHT4 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
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