Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Phf11cB4XVP9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Phf11cB4XVP9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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