Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Abcc8B2RUS7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Abcc8B2RUS7 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms