Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm15879-202ENSMUST00000150906 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 5330439A09Rik-201ENSMUST00000162770 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Olfr1447-201ENSMUST00000071484 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Olfr1446-201ENSMUST00000081236 1044 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Vmn1r4-201ENSMUST00000096612 1034 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apba1B2RUJ5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apba1B2RUJ5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms