Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
PtprbB2RU80 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms