Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

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Length 902 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Prrt4B2RU40 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms