Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rrn3B2RS91 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rrn3B2RS91 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms