Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brpf1B2RRD7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms