Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brpf3B2KF05 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms